Hallo,

>>>ich habe mittlerweile eine aktualisierte Lohnsteuerbescheinigung von 2016 erhalten

Hat der Arbeitgeber jetzt(!) eine neue erstellt, oder dir nur eine Kopie der alten ausgehändigt?
Ich frage das weil es sein könnte, dass das Finanzamt bereits die neue Bescheinigung berücksichtigt hat, das solltest du mal prüfen (im Bescheid kann man doch leicht erkennen, welcher Lohn berücksichtigt wurde).

Ansonsten brauchst du dir keine Sorgen machen, eine solche Änderung ist überhaupt nichts besonderes.

Stefan